Les techniques biochimiques analysent le matériel issu des plateformes Sclérochrologie, Histologie, Dissection et Biométrie.

3.a. Plateforme "Traceurs Chimiques et Isotopiques (TCI)
A partir des pièces issues de la sclérochronologie par l'étude du d18O des pièces calcifiées. Il est à l'heure actuelle, l'un des meilleurs outils pour estimer les conditions climatiques (actuelles ou passées) rencontrées par les organismes marins au cours de leur vie. Leur composition chimique élémentaire peut, quant à elle, permettre de détecter et de quantifier les pollutions actuelles, récentes ou anciennes.

Mesure des teneurs ioniques. L’équipement comprend un chloridimètre Aminco-Cotlove, un photomètre d’absorption atomique Varian AA 1275, un photomètre de flamme Sherwood.

 3.b. Plateforme "Physiologie Biochimique" (PB)

Les techniques sont surtout orientées vers l’exploration du métabolisme

hydrominéral.

Osmométrie. Les mesures d’osmolalité sont réalisables sur des prélèvements de milieux ou de sang/hémolymphe, sur des osmomètres Advanced Instrument 3300 (échantillon de 20 microlitres) et Roebling (7 microlitres). Elles peuvent être aussi effectuées sur des microquantités de liquide (30 nanolitres) grâce à un nano-osmomètre Kalber Clifton. Soulignons que cette nanotechnique, qui requiert la préparation de micropipettes, est particulièrement adaptée aux travaux sur les animaux de petite taille (minimum d’environ 300 micromètres) et n’est pratiquée que dans moins d’une dizaine de laboratoires dans le monde.

A partir des pièces issues de la sclérochronologie par l’étude de la composition microchimique des pièces calcifiées des organismes qui permet donc, non seulement de différencier les populations exposées ou non à certaines conditions environnementales  mais aussi, en cas d'espèces sédentaires (bivalves, certains poissons), de détecter les perturbations ponctuelles du milieu et de déterminer leur localisation et leur durée.

Séparation et quantification protéiques: le matériel disponible comprend: une cuve « Minigel G42, Biometra » pour la séparation protéique sur gel SDS-polyacrylamide; un appareil de transfert protéique «Trans-Blot SD semi-Dry Electrophoretic Transfert Cell» de BioRad; une cassette de développement et du film photo (Kodak® BioMax Light Film, Sigma-Aldrich) pour une révélation par chimioluminescence en chambre noire; un générateur «Consort EV 202,

Electrophoresis Power Supply»Un ensemble de membranes comme une membrane de nitrocellulose (Trans-Blot® Transfer Medium 0,2.µm, Biorad) ou une membrane PVDF (Westren Clear Signal 0,45 µm, Watmann Schleider & Schuell); une centrifugeuse «Eppendorf 5415 R, Fast Cool », de 0° à 40°C ; de 0 à 13 000 rpm (utilisée également en Biologie Moléculaire); un ensemble de plaque chauffantes, agitateurs, étuves, Centrifugettes, Vortex.

Ontogenèse embryonnaire. L’adaptation des macroorganismes à leur environnement et leurs interactions peuvent être très différentes lors de leur embryogenèse, par rapport au stade adulte. Cette plateforme met à disposition des outils qui permettent d’étudier le développement  embryonnaire in vitro avec ou sans modifications des paramètres abiotiques (température, présence/absence de lumière, salinité, pH) et biotiques (alimentation, régulation génique). Une étuve Sanyo MIR-153 permet de maîtriser les conditions de développements en terme de luminosité (présence/absence de lumière), de température et d’oxygénation. La température est stable à 0,5 °C est précise à 0,1 °C quelle que soit la température extérieure et est réglable de -10°C à 50°C. Jusqu'à trois cycles de températures différentes peuvent être utilisés afin de s’adapter au mieux aux conditions du milieu. Simuler le refroidissement pendant la nuit par exemple. Une demande pour une deuxième étuve est en cours afin de permettre l’étude de plusieurs espèces dans le même temps, ainsi qu’une loupe binoculaire (Leica MZ16FA + module ICA + Camera DC100) avec système à interférence et à fluorescence et unmicroinjecteur. L’ensemble de ces appareillages permet la micro-injection,  et le suivi de cette manipulation, d’éléments sous forme diluée aussi petits que des ADN, ARN, morpholino et si-RNA (le plus souvent marqué par des fluorochromes) dans des cellules.